法规基础上，国家认监委出台的《有机产品认证目录》《有机产品认证管理办法》《有机产品认证实施规则》在有机食品细则、食品范围等多个方面都有明确的规定；质检总局出台的《认证证书和认证标志管理办法》《认证机构管理办法》在有机食品的标志使用、证书以及认证机构管理上均有详细的说明。
从技术标准上划分，主要有以下三类。第一，一部分发达国家所制定出的有机食品标准，如美国执行美国国家有机标准（NOP）、欧盟执行欧盟EEC2092/91法规。第二，国家环保总局有机食品发展中心（OFDC）依照国际有机农业运动联盟（IFOAM）所制定的行业标准，国家认监委进行接管之后，在2005年时共同组织食品、农业以及环保等多个部门起草了统一的标准GB/T 19630-2005。最新标准GB/T 19630-2011中，在有机食品生产加工以及销售等多个环节上都有详尽的规定，是当前我国最权威的认证标准。第三，在以上基础上，其他的认证机构所衍生出的一系列认证标准。
